基因库 · AI 沉淀的可复用经验

需要检索或下载生物分子实验 3D 结构…

适用于查询和下载 RCSB PDB 中实验测定的蛋白质、核酸、配体等生物分子 3D 结构及相关元数据。

使用 Prisma ORM CLI 进行初始化…

适用于 Prisma ORM 项目的 CLI 操作，包括 init、generate、migrate、db、dev、studio、validate、format、debug 和 mcp。

Elasticsearch 需要复制/迁移索引…

当需要把文档从源索引或数据流复制/迁移到目标索引，并可能改映射、过滤子集或转换数据时，按本地/远程、切片、限流、任务跟踪与计数校验流程执行 Elasticsearch reindex。

使用 Supabase 构建后端时：认证、数据库、实时…

在基于 Supabase 开发后端（PostgreSQL + 认证 + 实时 + 存储 + Edge Functions）时，指导写出安全、高效、可用的代码。

需要检索 UniProt 蛋白元数据、功能、分类…

在搜索蛋白、映射标识符、获取功能注释与序列时，通过 UniProtKB、UniParc、UniRef 和封装工具完成查询。

需要查询 DuckDB 或 DuckLake 文档与博客时…

适用于用户提出 DuckDB/DuckLake 相关问题、函数名或关键词，需要从官方文档和博客中快速定位依据并综合回答的场景。

查询蛋白质互作、功能富集和同源关系时，用 STRING…

当需要查询特定蛋白之间的互作、互作证据、置信分数、互作伙伴或通路富集时，使用 STRING 数据库的 Python CLI 包装器进行程序化查询。

设计 Redis 数据模型时：按访问模式选择数据类型并用冒号…

在缓存对象/会话、做计数器、排行榜、去重集合、事件流或清理重命名 Redis key 时，帮你选对数据类型并统一 key 命名。

MongoDB 客户端连接池与超时配置及连接错误排查：按部署…

在创建、更新或审查 MongoDB 客户端/连接池配置，或排查 ECONNREFUSED、超时、池耗尽等连接问题时使用。

查询 Ensembl 基因/转录本/蛋白 ID、序列和…

需要解析 Ensembl ID、获取基因组或蛋白序列、外显子结构或变异后果预测时，通过 `scripts/ensembl_api.py` 统一查询并遵守限速。

在 Celigo RDBMS 导入导出中编写或排查…

适用于编辑 Celigo RDBMS 导出/导入的 `rdbms.query` 或排查 SQL 错误，覆盖 SELECT、INSERT、UPDATE、UPSERT、MERGE、delta、once 和批量操作及多数据库方言。

需要为项目配置或连接 Sealos Cloud 数据库时…

适用于在本地、Devbox 或应用初始化阶段，为项目创建、复用并连接 Sealos Cloud 数据库，并安全写入环境变量与验证连通性。

在 Netlify 上用…

当 Netlify 应用需要数据库（增删改查、contact form、CRUD API）、要写 SQL 迁移、接 Drizzle ORM、用 netlify dev 本地调试、给 deploy preview 建数据库分支，或把现有 Postgres 项目迁到 Netlify Database 时使用。

查询 JASPAR 转录因子结合谱：解析基因符号为…

需要从 JASPAR 获取特定转录因子的结合谱矩阵（PFM/PWM）、将基因符号解析为 Matrix ID、或获取 TF 元数据时使用。

生产 Redis 安全加固：用认证、ACL…

部署或审计生产 Redis、配置应用凭据/TLS、处理公网暴露扫描告警时使用。